La Transexología es la ciencia de los hechos transexuales (transvestistas, transgeneristas y transgenitalistas)
Para ser una ciencia, debe contar con una unidad de método que le permita describir con precisión los hechos, explicarlos por sus causas y hacer predicciones sobre ellos.
La unidad de método la consigue al situarse en una línea jerárquica del conocimiento que ha de ser la siguiente: Filosofía, Antropología, Sexología, Psicología, Endocrinología y Cirugía. Estos conocimientos van de lo más teórico a lo más práctico y por tanto, la Transexología será un conocimiento práctico, aunque sea en sus conceptos más generales, para las propias personas trans y, con mayor detalle, para los profesionales de quienes éstas requieran la ayuda.
Existe ya una considerable tradición de estudios sobre los hechos transexuales, empezando por Magnus Hirschfeld y Harry Benjamin. Pero sólo se podrán considerar transexológicos cuando se puedan insertar en la descrita unidad de método, que permite observar el punto preciso del que surjen las discrepancias, para así distinguir mejor su valor como conocimiento-error.
La Teoría de Género o Constructivismo sexual (Foucault, Butler) se separa de la Transexología desde el mismo principio, la Filosofía. Tienen en común sólo la voluntad de usar la razón, pero se separan en cuanto el linaje del conocimiento transexológico considera también la experiencia de lo dado, mientras que el de la teoría de género se mantiene en el puro racionalismo y voluntarismo.